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JMED-DICT-mini (ver 1.1.2)

奈良先端科学技術大学院大学 ソーシャル・コンピューティング研究室
JMED-DICT作業班
2025年4月30日

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概要

JMED-DICT-miniは，JMED-DICT（フルバージョン）のコアデータです．以下4つのサブデータについて，頻度上位のエントリのみを抽出しています．

フルバージョンはより大規模な用語をカバーしていますが，JMED-DICT-miniは一般的な使用やリファレンスに用いることを想定しています．

1. 病名データ
   症状や病名を収載．上位約100,000行を収録．

2. 医薬品データ
   医薬品名を収載．上位約30,000行を収録．

3. 部位データ
   人体部位表現を収載．上位約10,000行を収録．

4. 検査データ
   検査表現を収載．上位約10,000行を収録．（※後日公開予定）

病名データは上位100,000行を収録，医薬品データは上位30,000行を収録していますが，出現形，出現形よみ以外の情報は10,000行までしか付与されていません．

これは，出現形，出現形よみの情報のみでも十分応用の可能性があることに加え，10,000行以降のデータについては人手でのメンテナンスが十分実施されていないためです．

10,000行以降についても，今後の作業を通じてアップデートする予定です．

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仕様

属性情報

ラベル	概要	タイプ
ID	出現形に対応する一意に割り当てられたID．	文字列
出現形	医療テキストから抽出した，用語の出現形（ユニーク）．	文字列
出現形よみ	出現形のよみ．	文字列
正規形	出現形を正規化した表記．本データは既存リソースへのリンクが目的であり，正しい正規形や標準的な表現を提案するものではない．ビューアー上での表示や概念理解補助のための表現である．	文字列
TREE	最大4桁の記号による分類．ビューアー使用時のツリー構造表示に用いる．	文字列
出現形EN	出現形の英語訳．	文字列
出現形ZH	出現形の中国語訳．	文字列
用語難易度	用語の難易度	整数
REL:SITE-OF	エントリの症状が発生する体の部位	文字列
CLINICAL_DEPARTMENT	エントリの使用が予想される診療科	文字列
YEAR	エントリの収集年度	整数

• REL:SITE-OF, CLINICAL_DEPARTMENT は試験的に推定値を付与したものであり，信頼性は保証されません．

正規形のベース

サブデータごとに正規形のベースは異なる．

• 病名データ：標準病名マスター病名
• 医薬品データ：一般名
• 部位データ：ICD-11エクステンションコードをベースとした表現
• 検査データ：医師国家試験出題基準「主な検査項目の表記」をベースとした表現

出現形に対して複数の正規形が該当する場合，最大3つまでを半角セミコロン（;）で接続して列挙する．

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リンク先（最小セット）

リンク先のリソースによってライセンスの取り扱いは異なる．本データでは，ライセンスを持たない利用者でも利用可能な最小セットへのリンクのみ収録している．

リソース名	概要	病	薬	検	部
TO:SNOMED-CT-IPS	SNOMED-CTの縮小版．SNOMED-CT/International Patient Summary Terminology	✔️	✔️
TO:ICD-10	WHO制定の国際的病名分類（第10回改訂版）	✔️
TO:HPO	Human Phenotype Ontology 研究用フェノタイプ用語集	✔️
TO:薬効分類	日本標準商品分類番号に基づく医薬品効能分類		✔️
TO:一般名処方マスタ	医薬品一般名処方標準記載		✔️
TO:JLAC10コード	臨床検査項目分類コード（第10回改訂版）			✔️
TO:HOTコード	医薬品分類コード（HOT-9）		✔️

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信頼度

信頼度	概要
S	信頼度最大．既存リソースと照合済み
A	作業者3名以上がチェック済
B	作業者2名がチェック済
C	作業者1名がチェック済
D	自動推定結果

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見方

本データは一行一エントリ形式で，属性情報およびリンク情報を列単位で管理している．

各属性情報およびリンク情報には信頼度フラグが付与されている．

例：
ID5「高血圧」の出現形よみは「こうけつあつ」であり，flagがBであることから作業者2名が確認済であることを示す．

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参考資料・出典

TO:SNOMED-CT-IPS

• SNOMED International. “The International Patient Summary Terminology”
  https://www.snomed.org/international-patient-summary-terminology
• CC-BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)

TO:ICD-10，標準病名

• World Health Organization. “ICD-10 : international statistical classification of diseases and related health problems : tenth revision, 2nd ed.” 2004.
  https://www.who.int/standards/classifications/classification-of-diseases
• 一般財団法人医療情報システム開発センター．“ICD10対応標準病名マスター”．2024-06
  https://www2.medis.or.jp/stdcd/byomei/index.html

TO:HPO

• Gargano MA et al. The Human Phenotype Ontology in 2024: phenotypes around the world.
  Nucleic Acids Res. 2024 Jan 5;52(D1):D1333-D1346. doi:10.1093/nar/gkad1005

TO:薬効分類

• 総務省．“日本標準商品分類（平成2年6月改定）中分類87－医薬品及び関連製品”．2024-05
  https://www.soumu.go.jp/main_content/000294493.pdf

TO:一般名処方マスタ

• 厚生労働省．“一般名処方マスタ（令和6年6月14日適用）”．2024-06
  https://www.mhlw.go.jp/seisakunitsuite/bunya/kenkou_iryou/iryouhoken/shohosen_240401.html

TO:JLAC10コード

• 日本臨床検査医学会．“臨床検査項目分類コード第10版（JLAC10）”．2024-09
  https://www.jslm.org/committees/code/index.html

TO:HOTコード

• 一般財団法人医療情報システム開発センター．“医薬品HOTコードマスター”．2024-10
  https://www2.medis.or.jp/master/hcode/

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著作権について

本データがリンク先として利用しているリソースの著作権は，各リソースの作成者に帰属します．

本データを再配布や商用利用する際は，各リソース作成者のWEBサイト等で著作権等の権利関係を確認してください．

本データの使用により生じたいかなる問題についても提供元は責任を負いません．

お問い合わせ

JMED-DICT フル版の利用についてはJMED-DICT作業班にお問い合わせください．

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JMED-DICT-mini (ver 1.1.2)

Nara Institute of Science and Technology, Social Computing Laboratory
JMED-DICT Working Group
April 30, 2025

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Overview

JMED-DICT-mini is the core data of JMED-DICT (full version). It extracts only high-frequency entries from the following four sub-datasets.

While the full version covers more extensive terminology, JMED-DICT-mini is designed for general use and reference purposes.

1. Disease Name Data
   Contains symptoms and disease names. Approximately top 100,000 entries recorded.

2. Pharmaceutical Data
   Contains drug names. Approximately top 30,000 entries recorded.

3. Body Part Data
   Contains human anatomical part expressions. Approximately top 10,000 entries recorded.

4. Examination Data
   Contains examination expressions. Approximately top 10,000 entries recorded. (※ To be released later)

Disease name data records the top 100,000 entries and pharmaceutical data records the top 30,000 entries. However, information other than appearance form and appearance form reading is provided only up to 10,000 entries.

This is because sufficient information can be obtained from appearance form and reading alone, and data beyond 10,000 entries has not undergone sufficient manual maintenance.

Data beyond 10,000 entries will be updated through future work.

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Specifications

Attribute Information

Label	Overview	Type
ID	Uniquely assigned ID corresponding to the appearance form.	String
Appearance Form	The appearance form of the term extracted from medical text (unique).	String
Appearance Form Reading	Reading of the appearance form.	String
Normalized Form	Standardized notation of the appearance form. This data aims to link to existing resources and does not propose correct normalized forms or standard expressions. It is a representation for display on the viewer and to assist conceptual understanding.	String
TREE	Classification by up to 4-digit symbols. Used for tree structure display when using the viewer.	String
Appearance Form EN	English translation of the appearance form.	String
Appearance Form ZH	Chinese translation of the appearance form.	String
Term Difficulty	Difficulty level of the term	Integer
YEAR	Year of entry collection	Integer

Basis of Normalized Form

The basis of normalized form differs by sub-dataset.

• Disease Name Data: Standard Disease Name Master
• Pharmaceutical Data: Generic names
• Body Part Data: Expressions based on ICD-11 extension codes
• Examination Data: Expressions based on the Physician National Examination Standards "Major Examination Item Notation"

When multiple normalized forms apply to an appearance form, up to three are listed connected by half-width semicolons (;).

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Linked Resources (Minimal Set)

License handling differs depending on the linked resource. This data records only links to the minimal set that can be used even by users without licenses.

Resource Name	Overview	Dis	Drug	Exam	Part
TO:SNOMED-CT-IPS	Reduced version of SNOMED-CT. SNOMED-CT/International Patient Summary Terminology	✔️	✔️
TO:ICD-10	WHO-established international disease classification (10th revision)	✔️
TO:HPO	Human Phenotype Ontology research phenotype terminology	✔️
TO:Drug efficacy classification	Pharmaceutical efficacy classification based on Japanese Standard Commodity Classification		✔️
TO:Generic Name Prescription Master	Standard notation for generic drug prescriptions		✔️
TO:JLAC10 Code	Clinical examination item classification code (10th revision)			✔️
TO:HOT Code	Pharmaceutical classification code (HOT-9)		✔️

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Confidence Level

Confidence	Overview
S	Maximum confidence. Verified against existing resources
A	Checked by 3 or more workers
B	Checked by 2 workers
C	Checked by 1 worker
D	Automated estimation result

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How to Read

This data is in one-line-per-entry format, managing attribute information and link information in columns.

Each attribute information and link information is tagged with a confidence flag.

Example:
ID5 "high blood pressure" has an appearance form reading of "こうけつあつ" with a flag of B, indicating that two workers have verified it.

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References and Sources

TO:SNOMED-CT-IPS

• SNOMED International. "The International Patient Summary Terminology"
  https://www.snomed.org/international-patient-summary-terminology
• CC-BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)

TO:ICD-10, Standard Disease Names

• World Health Organization. "ICD-10 : international statistical classification of diseases and related health problems : tenth revision, 2nd ed." 2004.
  https://www.who.int/standards/classifications/classification-of-diseases
• General Incorporated Foundation Medical Information System Development Center. "ICD10 Standard Disease Name Master". 2024-06
  https://www2.medis.or.jp/stdcd/byomei/index.html

TO:HPO

• Gargano MA et al. The Human Phenotype Ontology in 2024: phenotypes around the world.
  Nucleic Acids Res. 2024 Jan 5;52(D1):D1333-D1346. doi:10.1093/nar/gkad1005

TO:Drug Efficacy Classification

• Ministry of Internal Affairs and Communications. "Japan Standard Commodity Classification (revised June 1990) Medium Classification 87 - Pharmaceuticals and Related Products". 2024-05
  https://www.soumu.go.jp/main_content/000294493.pdf

TO:Generic Name Prescription Master

• Ministry of Health, Labour and Welfare. "Generic Name Prescription Master (effective June 14, 2024)". 2024-06
  https://www.mhlw.go.jp/seisakunitsuite/bunya/kenkou_iryou/iryouhoken/shohosen_240401.html

TO:JLAC10 Code

• Japanese Society of Clinical Laboratory Medicine. "Clinical Examination Item Classification Code 10th Edition (JLAC10)". 2024-09
  https://www.jslm.org/committees/code/index.html

TO:HOT Code

• General Incorporated Foundation Medical Information System Development Center. "Pharmaceutical HOT Code Master". 2024-10
  https://www2.medis.or.jp/master/hcode/

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Copyright

The copyright of resources used as link destinations in this data belongs to the creators of each resource.

When redistributing or commercially using this data, please verify copyright and other rights relationships on the creators' websites and other sources.

The provider assumes no responsibility for any issues arising from the use of this data.

Contact

For inquiries regarding the full version of JMED-DICT, please contact the JMED-DICT Working Group.